2019年8月1日,表观基因组学专业期刊《Epigenomics》在线发表了省部共建药用植物功效与利用国家重点实验室杨珏博士为第一作者的研究成果“Identification of long noncoding RNA RP11-169F17.1 and RP11-669N7.2 as novel prognostic biomarkers of stomach adenocarcinoma based on integrated bioinformatics analysis”,我室宋辉为通讯作者。该研究成果首次发现lncRNA RP11-169F17.1he RP11-669N7.2可以作为胃癌预后分子标志物,有望成为一个治疗靶点。
幽门螺杆菌是一种革兰氏阴性菌,呈尿素酶、过氧化氢酶和氧化酶阳性,拥有3-5个单体鞭毛用于运动。与其他病毒和细菌不同,幽门螺杆菌可以通过尿素酶分解尿素产生氨,中和胃酸,使在自身周围产生一个中性的生存环境,选择性的定植于人的胃黏膜。世界上有超过50%的人群感染幽门螺杆菌,其中多数发展成为慢性炎症。多数人在感染幽门螺杆菌后并没有表现出任何症状。然而长期携带幽门螺杆菌会增加患胃病的风险,在幽门螺杆菌感染者中,超过10%发展成为消化性溃疡,1-3%发展成为胃癌,小于0.1%发展成为黏膜相关淋巴组织淋巴瘤。
研究人员利用生物信息学,发现在胃癌52个差异表达的lncRNAs中,上调的RP11-169F17.1和RP11-669N7.2与胃癌患者总生存率和无病生存率均显著相关。通过构建lncRNA-miRNA-mRNA作用网络和基因功能富集分析,发现RP11-169F17.1和RP11-669N7.2与肿瘤miRNAs调控、细胞增殖和分化等多种生物学过程密切相关。此外,研究人员还发现RP11-169F17.1和RP11-669N7.2可能在幽门螺杆菌感染引起的胃炎、十二指肠溃疡、胃癌及黏膜相关淋巴组织淋巴瘤中发挥重要作用。
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